Pioneiro no Brasil, o Núcleo São Paulo desenvolve atividades desde a fundação da Aliança pela Infância em 2001. Desde então, muitas ações se concretizaram, como a Campanha para o Desarmamento, o Curso de formação de Multiplicadores e o projeto Fazendo Arte na Biblioteca. Outros projetos que contam com o apoio a Associação Pró-Aliança pela Infância também são desenvolvidos por membros do Núcleo São Paulo, como Infância Vivenciada, Crianças Abrigadas e Contar História com Arte.
Os Fóruns Aliança São Paulo, em parceria com a Universidade Aberta do Meio Ambiente e Cultura de Paz (UMAPAZ) surgiram no âmbito do Núcleo São Paulo e, posteriormente, foram assumidos pela Gestão Nacional.
O Núcleo São Paulo também tem desenvolvido atividades durante a Semana Mundial do Brincar.
